Räkenskapsbok. Innehåller även begravningsbok (slutet har företrädersvis karaktär av räkenskaper) 1608-1616 (1618?), 1626-1628, anteckningar om sockenstämmor 1616, 1617-07-29, kyrkoinventarium 1609-02-26, 1629-06-14 och protokoll vid syn av Stabby prästgård 1616-05-01.
Volymen har ursprungligen varit skuldbok för "Stadens winkellare" (i Stockholm) med anteckningar från 1620-1621. Innehåller även förteckning över kommunikanter från Uppsala stad, odat. (1630-1660), anteckningar om sockenstämmor 1637-1641, kyrkoinventarium 1637, balkdelningslängd, odat. (1630-1660).
Huvudbok. Utgiftssidan (delvis även inkomstsidan) starkt specificerad. Innehåller även konfirmationslängd 1688-10-02, kyrkokassans skuldbok 1649-1692, kyrkoinventarium 1672-04-29, husesyner vid Stabby prästgård 1638-1693, avskrift av köpebrev enligt vilket mästaren Johan Jacobsson Krook säljer till Heliga Trefaldighets församling en gård, belägen mellan kyrkan och kapellet 1675-10-17, avskrift av Svea hovrätts utslag i tvisten mellan borgmästaren och rådet i Uppsala å ena sidan samt kyrkoherden i Heliga Trefaldighets församling Petrus Rudbeckius och häradshövdingen Johan Scheffer å andra sidan, angående stadens eller häradsrättens jurisdiktionsrätt i ett mål rörande kyrkofridsbrott i HelgaTrefaldighets kyrka 1688-09-28.
Räkenskapsbok för klockringning och begravningsplatser. Innehåller ävenredogörelse för kyrkan, kyrkoinventarium, kyrkliga boställen och socknens hus m.m. under Petrus Rudbeckii tid (1674-1692) 1692 och ringnings- och gravplatstaxa 1682.
Ärkebiskop Stigzelii räkenskaper med Helga Trefaldighets församling. Innehåller även diverse verifikationer till kyrkoräkenskaper 1669-1674 och handlingar och räkenskaper rörande kyrkklockan 1662-1673.
1693-1718, 1725-1803. Innehåller även kyrkoinventarium 1693-05-06, 1695-07-01, protokoll vid husesyn av Stabby prästgård 1693-05-15, 1695-05-23, anteckningar om en gåva till kyrkan, mars 1772, series pastorum 1670-1803, anteckning om biskopsvigning i Heliga Trefaldighets kyrka 1781-02-25.
Räkenskaper och verifikationer. Innehåller även räkning över utdelade fattigvårdsmedel 1727-1739 och kyrkoinventarium 1726-09-08,1729-10-09, 1738-05-24.
Inkomst- och utgiftskladd. Innehåller även fattigkassans inkomst- och utgiftskladd 1840-1853, lasarettsmedelsräkenskaper 1840-1853, orgelbyggnadsfondens räkenskaper (kladd) 1841-1854, taxa för begravningsringning 1826.