Kriminalvårdsmyndigheten Uppsala inrättades 1998-01-01. Myndigheten bestod av följande enheter: Staben, Frivården och Anstalten Åby. Kriminalvårdsmyndigheten upphörde som egen myndighet 2005-12-31 och ingår därefter som ett Verksamhetsområde i den centrala myndigheten Kriminalvården.