Ekeberg, släkt från Uppland, synes härstamma från arrendatorn å Banérska släktgodset Djursholm i Danderyds sn (Sth.) Gustaf Ekeberg (begr. 5 okt. 1718), enär hans son säkerligen var den Gustaf Gustafsson E., som var frälsekamrer vid Djursholm och g. 1715 m. Catharina Ebba Fast. Danderyds dopbok upptar endast tre deras döttrar, men som söner anges (i minnestalet över E. 1 i Vetenskapsakademien) tre: ostindiefararen, amiralitetskaptenen Carl Gustav E. (E. 1), inspektören vid Vattholma bruk Johan Fredrik E. (f. 1720, d. 1792) samt skeppsbyggmästaren vid örlogsflottan, kaptenen vid konstruktionsstaten Joseph Eric E. (f. omkr. 1726, d. 1793). Den sistnämndes son var kemisten, akademiadjunkten Anders Gustaf E. (E. 2).