Skytteanska depositionen, även stundom benämnd Deposition Skytteana, består av fyra olika delarkiv, betecknade I - IV.
Delarkiv I innehåller främst handlingar rörande Skytteanska stiftelsens undervisning (politisk historia, lagar, förordningar, föreläsningsanteckningar), vitterhet och poesi. Även inbundna medeltidshandskrifter ingår i arkivet, som framåt i tiden sträcker sig till slutet av 1800-talet.
Delarkiv II innehåller handlingar av judiciell art (stiftelseurkunder och fastebrev, handlingar rörande Skytteanska professuren, Skytteanum, stiftelsens hemman, stipendier samt Gyllenhielmska biblioteket). Delarkivet omfattar tiden 1595 - 1924.
Delarkiv III innehåller handlingar av judiciell art och därutöver åtskilliga skrivelser rörande professuren, hemman med mera. Huvuddelen av delarkivet stammar från greve Mörner under dennes tid som patronus och omfattar 1800-talet.
Delarkiv IV omfattar till patronus inkomna brev, handlingar rörande fastighetsfrågor och räkenskaper (samt enstaka handlingar rörande professuren). Delarkivet omfattar tiden från det sena 1700-talet till 1960-talet med tyngdpunkt på 1900-talet.
Arkivhistorik
Deposition (1933, 1941, 1974). Se vidare under respektive delarkiv.