I samband med hospitalets i Nya Lödöse omdaning till Göteborgs stads hospital inköptes och utflyttades tyska församlingens träkyrka och blev gudstjänstlokal ej allenast för hospitalsmedlemmarna, utan även för den kringliggande landsbygdens befolkning. Invigningen förrättades år 1627. Jämte Örgryte utgjorde församlingen annex till Domkyrkoförsamlingen. Under åren 1712-1796 bildade Örgryte och Hospitals- församlingen gemensamt pastorat. Bekräftelse å sina rättigheter erhöll församlingen genom ett kungligt brev 22/2 1827 (Kungl. brev till Consistorium i Göteborg år 1827 nr 33.)

Då territorialindelningen genom ett kungl. brev 5/5 1882 blev ett faktum upphörde församlingen att finnas till i och med april månads utgång 1883. Församlingsmedlemmarna blevo kyrkskrivna i Gamlestadens territroiella församling.