Ilsbo församling bildades under medeltiden och ingick i gemensamt pastorat med Rogsta församling (moderförsamling) fram till 1918. Församlingen överfördes därefter till ett pastorat med Hälsingtuna församling (moderförsamling) och Högs församling.

1962 ändrades pastoratsindelningen och Ilsbo församling kom att ingå i ett gemensamt pastorat med Harmångers församling (moderförsamling) och Jättendals församling. År 1977 ändrades pastoratstillhörigheten igen och församlingen bildade då gemensamt pastorat och kyrklig samfällighet med Bergsjö församling (moderförsamling). Den 1 januari 1995 utökades pastoratet och samfälligheten med Hassela församling.

I Hälsingtuna kyrkoarkiv ingår gemensamma handlingar för pastoratet t.o.m. 1962. Harmångers, Jättendals och Ilsbo församlingars pastorat fr.o.m. 1962 bildar ett särskilt arkiv. Ekonomihandlingar och vissa fastighetshandlingar ingår i arkivet. I Bergsjö kyrkoarkiv ingår gemensamma pastorats- och samfällighetshandlingar från 1977.

I husförhörslängder A I:5-6 upptas innevånare från Järnblåstern i Norrbo socken som från år 1826 enligt särskilt medgivande deltog i nattvard och husförhör i Ilsbo församling.