Indals församling bildades under medeltiden. Församlingen utgjorde ursprungligen eget pastorat för att sedan vid okänd tidpunkt under medeltiden bilda pastorat som moderförsamling till Lidens församling och Holms församling. Pastoratet delades genom beslut 1889, ikraft den 1 maj 1891, i två pastorat och Indals församling utgjorde åter ett eget pastorat medan de två andra församlingarna i det tidigare pastoratet bildade ett nytt gemensamt pastorat.

Enligt kungligt brev den 21 juni 1861 flyttades Nilsböle och Överböle hemman från Indals till Lidens socken i administrativt och ecklesiastikt hänseende. Byarna hade dock räknats till Lidens församling sedan tidigare.
                                                        
Enligt länsstyrelsens beslut ska från den 1 januari 1981 del av Krånga 1:21 och 1:42 i Indals jordregistersocken överföras från Sättna församling till Indals församling och del av Strömnäs 2:9 i Sättna jordregistersocken överföras från Indals församling till Sättna församling. Samtidigt ska del av Östbyn 2:42 i Holms jordregistersocken överföras från Indals församling till Holms församling.