Länsstyrelsens arbete indelades från starten under 1600-talet i en kameral del och en allmän del. 1687 infördes benämningarna landskontor och landskansli. Chef för landskansliet blev landssekreteraren. Landskansliets arbete utgjordes av ärenden om bland annat polis, fångvård, fattigvård, pass, skjutsväsen, gästgiverier och försvarsfrågor.
Till en början utgjorde hela Uppland ett län och landshövdingen hade sitt säte i Stockholm. 1714 delades storlänet i Stockholms län och Uppsala län. Uppsala läns landskanslis arkiv innehåller dels handlingar från länsstyrelsen i storlänet, dels handlingar från länsstyrelsen i Uppsala län efter år 1714. Detta arkiv, Landskansliet I, består av handlingar huvudsakligen från åren 1625-1874.
Landskansliets verksamhet har gett upphov till ett omfattande och varierat material. Arkivet innehåller bland annat utgående brev (koncept), diarier, liggare och register. Bland de senare kan nämnas passjournaler (C I) och fångjournaler (C II). Den största delen av Uppsala läns landskanslis arkiv utgörs av inkomna handlingar (D). Bland dessa finns skrivelser från myndigheter, kronans tjänstemän i länet och privatpersoner. Skrivelser från enskilda personer återfinns främst i den mycket omfångsrika serien Avgjorda mål (D IV). Arkivet innehåller även handlingar ordnade efter ämne (E). Här finns exempelvis material angående skogar och allmänningar, krigsmakten, skjuts- och gästgiveriväsendet samt fångvården.
Arkivhistorik
Uppsala läns landskanslis arkiv, bortsett från huvudavdelningarna D I och D II, omförtecknades 1998 inom ramen för ett SESAM-projekt av Karin Dahl.
Serien i buntar t.o.m. volym 181 och inbunden fr.o.m. volym 182. Serien är en fortsättning på A I a (Registratur). Serien innehåller även utgående diarier 1682-1727. Fr.o.m. volym 80 är serien försedd med register om ej annat anges. Serien upphör. Fortsätter i serierna A I c (Protokoll och brevkoncept) och A II (Utslagskoncept).
Förteckningar över utgående skrivelser finns, förutom i här redovisade diarier för åren 1634 - 1638, även - med undantag för vissa år - för perioden 1640 - 1680, i form av register till registraturet, serie A I a. Under åren 1682-1727 finns diarier över utgående skrivelser arkiverade tillsammans med brevkoncepten i serien A I b. I samma serie finns register till breven för perioderna 1728 - 1828, 1831 - 1833 och 1835 - 1836, samt för år 1839.
Serien i buntar t.o.m. volym 20 och inbunden fr.o.m. volym 21. Serien innehåller diarier över inkomna skrivelser från Kungl. Maj:t samt centrala och lokala myndigheter. Diarierna är uppställda efter avsändare t.o.m. volym 26 och kronologiskt fr.o.m. volym 27. Diarier över inkomna skrivelser från Kungl. Maj:t och centrala myndigheter finns även i serierna D I (Skrivelser från Kungl. Maj:t och vissa centrala myndigheter), fr.o.m. 1680, och D II d (Skrivelser från centrala myndigheter (gemensam serie)), fr.o.m. 1689. Register över ankomna brev och författningar från Kungl. Maj:t och kollegierna för åren 1678-1679, 1689-1691 samt 1772-1804 finns även i serien C VIII (Register över ankomna brev och författningar). Volymerna är försedda med register om ej annat anges.
Serien i buntar. T.o.m. volym 6 innehåller serien utsöknings- och supplikdiarier. Fr.o.m. volym 7 innehåller serien utsöknings-, ekonomi- och politiediarier om ej annat anges. Serien innehåller även saköreslängder.
Serien inbunden. Serien är en fortsättning på B II (Ingående diarier utom brevdiarier). Serien innehåller diarier över ekonomi- och besvärsmål men även olika typer av ansökningsdiarier samt saköreslängder.
Övriga skrivelser från hov- och stallstaten, se serie D II d. Serien innehåller även skrivelser från riksmarskalken m.fl. hovämbetsmän, se vidare serie D II an.
Serien i buntar. Serien innehåller huvudsakligen inkomna handlingar från enskilda personer från slutet av 1600-talet och början av 1700-talet. Volymerna är uppställda alfabetiskt.
Serien i buntar. Serien innehåller olika typer av månadsrapporter från magistraten i Enköping, bl a brevrapporter, månadstaxor och förteckningar över utfärdade resepass.
Serien i buntar om ej annat anges. Serien innehåller generalmönsterrullor men även approbations- och kassationsmönsterrullor över manskap och hästar samt andra mönsterrullor.
Serien i kartonger. Serien innehåller intyg från präster och läkare angående beväringsmanskapet samt andra handlingar angående beväringen. Åren 1817, 1835 och 1859 saknas.
Serien i kartonger. Serien innehåller olika typer av militära handlingar som inte har kunnat föras till någon av de andra serierna angående militärväsendet och krigsmakten.
Serien i kartonger. Serien innehåller handlingar och räkenskaper av, till och rörande häradshövdingar, häradsskrivare, kronofogdar och lantmätare. Huvuddelen av handlingarna är från slutet av 1600-talet och början av 1700-talet. Volymerna är uppställda alfabetiskt efter tjänstemännens namn.